Hô hấp kị khí hay còn gọi là hô hấp yếm khí là hô hấp sử dụng chất
ôxi hóa khác không phải ôxi. Tuy ôxi không được sử dụng như chất nhận
electron (
chất oxy hóa) cuối, quá trình vẫn sử dụng một
chuỗi chuyền electron gọi là physolmere; sự hô hấp không có ôxi.
[1]Trong quá trình hô hấp của
những sinh vật hiếu khí, electron được gắn kết vào một chuỗi chuyền electron, và chất oxy hóa cuối là ôxi. Phân tử ôxi là một chất có tính
oxy hóa rất cao, do đó nó là một chất nhận electron xuất sắc. Ở những
sinh vật yếm khí, những chất ít oxy hóa khác như là
sunfat (SO42−),
nitrat (NO3−),
sulfur (S), hay fumarat được sử dụng. Những chất nhận electron cuối này có khả năng khử kém hơn O2, có nghĩa là có năng lượng ít hơn được sản sinh ra trên mỗi phân tử bị oxy hóa. Vì vậy, ta có thể nói rằng, hô hấp yếm khí kém hiệu quả hơn
hô hấp hiếu khí.Hô hấp yếm khí được sử dụng chủ yếu bởi các
vi khuẩn và
cổ khuẩn sống trong môi trường thiếu thốn ôxi. Nhiều
sinh vật yếm khí thuộc trong dạng
yếm khí bắt buộc, tức là chúng sẽ chỉ hô hấp được với những hợp chất yếm khí và sẽ chết nếu có sự hiện diện của ôxi.